Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms