Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Tmeff1Q6PFE7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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