Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms