Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt40Q6IFX3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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