Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PnkdQ69ZP3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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