Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrhQ62361 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrhQ62361 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TrhQ62361 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms