Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim28Q62318 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim28Q62318 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Trim28Q62318 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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