Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SnrpcQ62241 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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SnrpcQ62241 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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