Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpaQ62189 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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