Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sema3cQ62181 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms