Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klf3Q60980 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms