Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
JrkQ60976 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms