Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HellsQ60848 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms