Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms