Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim41Q5NCC3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms