Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccnl1Q52KE7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms