Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx33Q4VAA7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx33Q4VAA7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Snx33Q4VAA7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx33Q4VAA7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms