Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC051142Q3V0M8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC051142Q3V0M8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms