Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms