Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms