Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ulk3Q3U3Q1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms