Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hvcn1Q3U2S8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hvcn1Q3U2S8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hvcn1Q3U2S8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hvcn1Q3U2S8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hvcn1Q3U2S8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms