Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Otud5Q3U2S4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms