Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms