Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms