Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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