Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrc2cQ3TLH4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrc2cQ3TLH4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc2cQ3TLH4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms