Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prr27Q3SYJ2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms