Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms