Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms