Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli2Q0VGT2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli2Q0VGT2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms