Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
MitfQ08874 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MitfQ08874 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms