Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnma1Q08460 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms