Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Calb2Q08331 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Calb2Q08331 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms