Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gdf3Q07104 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms