Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cab39Q06138 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms