Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoc2Q05020 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms