Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms