Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms