Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nme2Q01768 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms