Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gbp1Q01514 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms