Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms