Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1bP97358 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Taf1bP97358 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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