Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms