Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gabra1P62812 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gabra1P62812 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gabra1P62812 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gabra1P62812 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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