Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms