Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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