Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sh3bp1P55194 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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