Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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PctpP53808 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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