Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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